Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc17E9PVB5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc17E9PVB5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc17E9PVB5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc17E9PVB5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc17E9PVB5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc17E9PVB5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc17E9PVB5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc17E9PVB5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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