Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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