Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms