Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms