Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NhsB1AV60 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms