Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Atp8b5A3FIN4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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