Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms