Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Lcn6A2AJB9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Lcn6A2AJB9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lcn6A2AJB9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lcn6A2AJB9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lcn6A2AJB9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lcn6A2AJB9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lcn6A2AJB9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn6A2AJB9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms