Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms