Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A0U1RNP2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms