Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms