Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcniQ9Z2V9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcniQ9Z2V9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms