Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hdac6Q9Z2V5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hdac6Q9Z2V5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hdac6Q9Z2V5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hdac6Q9Z2V5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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