Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms