Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms