Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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