Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms