Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms