Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Fscn3Q9QXW4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Fscn3Q9QXW4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Fscn3Q9QXW4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Fscn3Q9QXW4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Fscn3Q9QXW4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fscn3Q9QXW4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Fscn3Q9QXW4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fscn3Q9QXW4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fscn3Q9QXW4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fscn3Q9QXW4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fscn3Q9QXW4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fscn3Q9QXW4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms