Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms