Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms