Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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