Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms