Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms