Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Trim39Q9ESN2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Trim39Q9ESN2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Trim39Q9ESN2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Trim39Q9ESN2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Trim39Q9ESN2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms