Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ush1cQ9ES64 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ush1cQ9ES64 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ush1cQ9ES64 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ush1cQ9ES64 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ush1cQ9ES64 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ush1cQ9ES64 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ush1cQ9ES64 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ush1cQ9ES64 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ush1cQ9ES64 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ush1cQ9ES64 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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