Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms