Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms