Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr88Q9EPB7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms