Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl4Q9DCU6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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