Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms