Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Usp12Q9D9M2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Usp12Q9D9M2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Usp12Q9D9M2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Usp12Q9D9M2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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