Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Snx5Q9D8U8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Snx5Q9D8U8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Snx5Q9D8U8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Snx5Q9D8U8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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