Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3404Q9D506 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.8 ms