Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms