Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms