Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stag1Q9D3E6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms