Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms