Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms