Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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