Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp3Q9D032 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ssbp3Q9D032 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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