Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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