Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms