Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl11Q9CXW4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms