Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp23Q9CX11 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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