Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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