Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Snx10Q9CWT3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx10Q9CWT3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx10Q9CWT3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx10Q9CWT3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx10Q9CWT3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx10Q9CWT3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx10Q9CWT3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx10Q9CWT3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx10Q9CWT3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx10Q9CWT3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx10Q9CWT3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx10Q9CWT3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms