Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms