Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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