Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccer1Q9CQL2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccer1Q9CQL2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccer1Q9CQL2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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